Samojedin turkin kunnossa pitäminen ei ole niin vaikeaa kuin miltä se saattaa ensisilmäyksellä vaikuttaa. Turkkia harjataan kasvusuuntaan. Ennen harjaamista karvakimppu erotetaan käsin ja vedetään vastakarvaan. Turkin takut selvitetään harjaamalla ne huolellisesti auki. Harjauksen yhteydessä on turkki myös föönattava. Harjauksen lopuksi tulee vielä vetää harjalla vastakarvaan aluskarvan nostamiseksi. Samojedien trimmausta ei suositella. Karvapeitteen luonnollinen pituus suojelee auringossa koiran ihoa palamiselta sekä kuumuudelta ja kylmyydeltä. Hygieniasyistä karvaa voi lyhentää hieman käpälien yläpuolelta ja peräaukon ympäriltä, päkiöiden välistä karvan voi leikata kokonaan. Samojedinkoiran aluskarva lähtee 1-2 kertaa vuodessa, mikä tekee sen hoidosta hieman hankalamman. Karvapeite tulee pestä kuivashampoolla, erityisesti pentua pestäessä. Jotta samojedinpentu kehittyisi täysipainoisesti, on turkin hoitamisen lisäksi huolehdittava myös riittävästä liikunnasta. Kuten täysikasvuisesta samojedista myös pennusta tulee ärtyisä mikäli se ei saa virikkeitä. Sekä pentujen että täysikasvuisten samojedin korvat tulee puhdistaa. Päivittäiset pitkät lenkit ovat samojedille tärkeitä, mutta pentujen ulkoiluttaminen ensimmäisten kolmen kuukauden aikana, ennen kuin tarvittavat rokotukset on tehty, ei ole suositeltavaa ja jopa vaarallista. Samojedi on vetokoira, jolle pitkäaikainen oleskelu ulkoilmassa on erittäin tärkeää. Samojedin hoito edellyttää, että sille annetaan riittävästi liikuntaa, josta samojedi nauttii suuresti.
Mikäli samojedi ei pidä turkin harjauksesta, ei sitä kannata kiusata sillä. Ota tavallinen harja (tai pitkäpiikkinen trimmausharja) siten, että koira ei näe sitä, käy lattialle koiran viereen silittelemään sitä. Kun koira rentoutuu, voi sitä alkaa hiljakseen harjailemaan. Jos koira laittaa vastaan, jatka harjaamista rauhoitellen koiraa juttelemalla sille. Pidä samalla koirasta kiinni lujasti, mutta hellästi. Kun koira sallii harjaamisen, on aika siirtyä pohjavillanpoistajaan. Varo kuitenkin alussa äkillisiä liikkeitä ja käytä sitä yhtä tasaisesti kuin aiemmin harjaa. Yleensä jo ensimmäisellä kerralla onnistuu siirtyä harjasta pohjavillanpoistajaan.